回到四个柱体的房间里，对左上的柱体使用生长，右上使用降雨，左下使用火球，右下使用旋风，最后的大门开启。

门内就是炼金术发动机，封印着露娜之塔(月之塔)，靠近中央发生剧情，在众人纠结于到底能不能启动炼金术发动机时，在恭帕遗迹曾经和斯佩德一起现身的面具男和斯佩德、哈特再次出现!BOSS战开始!

打败斯佩德和哈特后得到电磁苦无和香水(都是战斗道具)，然而，在没有注意到的时候，宝山已经昏迷，满月的光照射到这里，刘项在面具男的威胁下把地壳宝珠放进了台座，启动了炼金术发动机!

面具男提到他并不是兹亚帕兰人，自称名叫艾斯(扑克牌的王牌)，他说这座月之塔封印的也是大自然的力量，但是却是不可开启的禁断之力，说着，塔里发生了剧烈的晃动，艾斯带着斯佩德与哈特逃离了这里，众人也急忙离开。

“如果我们能在塔外再次相见的话，我们再继续这个话题吧。”——这家伙终于把当年二代末尾贤者给他的那句话还了回来……

从右边上台阶，一路向上逃吧，中途有好几处浮游石要用旋风吹起，走出去就来到了露娜之塔。沿着盘旋的楼梯登上塔顶，调查石板，获得召唤兽——2水3风的日蚀。

从塔的1F下面出口离开，目击到巨大的月亮。

往右走，乘坐竹筏得到下面的宝箱里的生命面包。

回到贝尔夫奈吧，还记得西面民居里有只水精灵吧?从西面台阶右边的门进入，在里面看到两位兽人躺在床上(旁边的衣柜里有件无二长袍)。与上面那位兽人对话，他会起床上个厕所然后回来。走出卧室，发现衣柜和书架之间多了一滩水——天哪这叫什么事啊……

先用降雨浇灭壁炉里的火焰，然后对水滩使用冰冻结成冰柱，然后爬上书架，跳到衣柜上，爬上衣柜获得水精灵希特拉斯。

下面去王城吧。走进王城，先上二楼的楼梯，对走廊里的铃铛使用拍打，守卫的士兵就会被引开，走进他身后的门，获得王城顶端宝箱里的野兽之爪。

回到一层，进门，先往右上楼，发生剧情，波尔特奇诺打开了牢门，放出了宝珠。这时斯库雷塔终于也出现了，斯库雷塔责备波尔特奇诺策划开启了日蚀之塔，然而，从字里行间，我们深深地体会到波尔特奇诺作为一国之主为摩尔格尔着想的拳拳之心。

斯库雷塔催促大家快点去救雷奥雷奥，因为接下来将有一场巨大的异变，贝尔夫奈将不再安全……在斯库雷塔的坚持下，三位萨纳国来的非精神力者先行离开了贝尔夫奈……

看守宝珠的牢房里的罐子里有个力量苹果。众人一路来到王城的左侧，看到了笼子里的雷奥雷奥，用拍打把笼子打下来吧。然后到笼子落下的地方，发生剧情，太阳与月亮重合，以月亮之塔为中心扩散出一片巨大的阴影，笼罩着整个贝尔夫奈……

城中出现魔物袭击，离开王城时，史黛拉感觉到波尔特奇诺带领士兵把魔物逼进了剧院，在演出的舞台上，背后的门关上，各种乐器的声音逐一响起——波尔特奇诺陷入了魔物的圈套!舞台的大幕拉开，魔物出现了……

快赶去剧院吧。要从高高的城墙上绕过去。一路绕到舞台上。发生剧情，天花板上的水晶灯变化成了一条龙!之前在剧院里说她为水晶龙带饭的小女孩跑了出来，被魔物一击打飞，穆特等人大怒，冲上去击败小BOSS黑暗食尸鬼，可是小女孩还是死了……剧情后获得召唤兽——3地2水的水晶龙。这貌似是唯一一个前作没有的召唤兽。

剧情后离开墓地，来到贝尔夫奈的港口，发生剧情，原来帕亚亚姆已经把船开到了这里，而帕亚亚姆却倒在船上人事不省……再发生一次战斗，击倒怪物后继续剧情，帕亚亚姆对儿子说了几句话后也死了……

海葬过后，雷奥雷奥加入穆特的队伍，操纵这艘船。与雷奥雷奥对话，开船。

随着船的开动，史黛拉听到月之塔的塔顶传来波尔特奇诺的声音，波尔特奇诺痛苦于自己被兹亚帕兰人欺骗，从他们身上抢到一颗“蓝色光珠”，从塔顶用精神力送到史黛拉手里，然后向史黛拉道了永别，义无反顾地走进塔里……

冲过一阵大风大浪之后，船终于在水面上平稳下来……继续剧情，剧情后雷奥雷奥指导船的使用。雷奥雷奥带来五只火精灵：拜卡、拉斯、尼特罗、莱兹、麦提。此时应该有地精灵11只，水精灵13只，火精灵12只，风精灵14只了。