☆地之圣者
冒险区域：Headstone Island -> Dragon Roost Island -> Headstone Island
2件秘宝得到后，可以前往神殿了，首先来到石头岛上的神殿Headstone Island，入口有一尊大石像，走到跟前举起来砸掉，进入洞穴。
洞穴内没有通路，只有一块巨大的石碑，上面标着古代音乐的旋律。拿出风之杖，按照上面的旋律演奏吧，可以学会地圣者之曲 Earth God's Lyric。
入手乐曲地圣者之曲 Earth God's Lyric
用途打开地之神殿之门，并开启神殿内部的部分机关
使用方法用风之杖演奏，先按住左摇杆右，再按C键下-》C键下-》空-》C键右-》C键左-》空，此曲乃攻略地之神殿必备之曲
这时，一个幽灵出现了，告诉林克她的名字是Laruto，Zora族的后代，也是守护地之神殿的圣者，但是地之神殿已经被怪物占领，她的灵魂也被禁锢起来了，无法帮助林克恢复圣剑的魔力。唯一的方法是去寻找现在世界上仍然生存的地之圣者，她也拥有一把金色竖琴。她告诉林克需要在那个未苏醒的圣者面前演奏地圣之曲，就会唤醒她。
那么这个转世的地之圣者究竟在哪里呢?唯一的线索也就是持有金色竖琴的人。如果你观察力和记忆力都足够的话，不用提醒也可以想到是谁了吧。就是曾经在龙之岛上帮助过林克的鸟人Medli。那么赶快前往龙之岛吧。
在龙之岛的山脚下就会听到悠扬的竖琴声，通过鸟人族的起居地来到最顶部，就会看到Medli在悬崖边的平台上独自弹奏着，用绳钩钩住枝杈跳过平台，来到 Medli那里，林克拿出风之杖。Medli很高兴的希望林克与她一起演奏，奏起地圣之曲吧，Medli听完会进入梦境，以地之圣者的面貌苏醒，并且会演奏非常美妙的一段旋律。她已经知道了自己的使命，希望林克带她一起前往地之神殿。
返回地之神殿的入口，在石碑前与Medli合奏地圣之曲，石碑就会打开通路，前方就是机关重重的地之神殿了。
☆迷宫：地之神殿
冒险区域：Earth Temple
迷宫地图
从这个迷宫开始，会进行2人组对冒险，在同伴附近时按R键可以呼唤同伴同行，走到同伴前按A键可以把同伴举起来，按R键可以放下同伴，吹奏号令之曲可以操作同伴，操作同伴时按R键可以切换回操作林克。这些操作会经常用到，要注意掌握。
区域1：先把Medli抛过去，林克在用德古叶飞过去，举着Medli进门。注意，每次进门都要举起Medli通过，不然她就会被留在前一个区域了。
区域2：先消灭这里的所有敌人，走到区域中部时，Medli会说她想尝试飞行，林克只要举着她到高台处按A键抛出，她就会学会。从此，在举着Medli跳跃时，Medli就会飞起来并拖着林克一段时间。这个区域有2根柱子，先举着Medli走到高台上方然后对着前面的柱子跳过去，Medli就会带着林克飞行到柱子上，林克踩住这里的开关，然后演奏号令之曲，操作Medli飞到另一根柱子上踩住另一个开关，机关解除，门打开了。
区域3：这里出现了紫色的Chuchu怪，任何攻击对它们都无效，其实它的弱点是光，在区域中央有一片光芒照射的地方，引诱它过来，它在光线下就会变成石像，举起来摔碎即可消灭它。把这里所有的敌人都消灭通道就会打开。不要着急，你也许已经注意到了，Medli的竖琴实际上是一面反光镜，在光芒下可以按A 键调整光的照射位置，对准对面台上的透明宝箱，宝箱就会出现原形，在里面取得迷宫地图 Dungeon Map。另外，Medli的竖琴还可以照射石像，阳光图案等让这些机关解除。
用光反射和切换同伴是本迷宫的解谜基本准则
区域4：一进去就看到远处有一座2只眼睛的大雕像，下方地面上笼罩着蓝雾，走进去的话林克会被暂时诅咒，无法攻击和使用装备，先不管他。还有2处光束，这里才是关键。切换成Medli，站在右边的光束处对着蓝雾照射，雾会散开，露出一个大开关来。切换回林克，用锤子砸下开关，区域东边的门就会打开。如果你离开Medli太远(相隔几个区域)的话，她会被怪物抓走关在这个区域上方的牢房内，只要切换成Medli飞出来就可以了。
区域5：林克爬上梯子推开巨石，光束会照射进来。切换成Medli在光束下照透明宝箱，取得钥匙 Small Key。注意这里会出现地面升出的怪手，假如林克被抓住的话会被抛回区域4，所以要小心一点，把手引诱出来后用弓箭可以消灭。
区域4：进入西部的带锁门。
区域7：又出现一群Chuchu怪真是烦人。先用火之箭射掉南方墙上的红色挂帘，光束会照进来。然后需要一点小技巧了，需要让2只紫色怪进入光束变成石像，然后搬起石像放在2个开关上，北部的楼梯就会出现，这时带着Medli快速上楼梯，因为紫色怪一段时间后是会恢复的。上高台以后把石块推下去，以后就可以走快速通路了。
区域8：先消灭怪手，把近处的石块推进去，光束出现。切换成Medli，照射有太阳标志的墙壁，会出现可移动的石块。切换回林克，先把Medli抛上去，然后拉到尽头做梯子爬到上层，坛子里有3只Fairy哦。
区域9：新怪物：隐型幽灵出现，它们会附身攻击，使林克暂时混乱，小心点。让Medli飞到上层光束处照射幽灵，它们就会现身，这时快速切换回林克，即可干掉幽灵。消灭这个区域的全部敌人后，楼梯出现。进入东南部的门。
区域10：又有新怪物出现：木乃伊。OOT里的老对头了，它们的注视会让林克暂时无法行动。乱刀砍掉。在某个棺材里取得钥匙 Small Key。消灭全部木乃伊后，梯子落下，返回。
区域9：进入南部的带锁门。
区域11：小型BOSS战开始!敌人是抡大锤的骷髅，攻击它的身体一段时间后，头部会脱落，这时赶快攻击头部，弱点就在头部。消灭头部后即可在宝箱内取得重要装备：镜之盾 Mirror Shield。想返回的时候会发现门关上了，站在光束下，用镜之盾反射到门上的太阳，点亮太阳后门会打开。终于，林克也可以使用光反射了。
入手装备镜之盾 Mirror Shield
用途在光束下可以反射光线，与Medli的竖琴配合可以连续反射
使用方法自动装备，替代掉勇者盾，仍然可以做防御用
区域9：回到这里，让Medli飞上高台站在光束处，把光反射到下方，按R切换成林克，利用Medli反射的光再发射到墙上的太阳图，墙壁就会打开。双反射的用法你学会了吧?在进入通道后用双反射可以粉碎墙壁得到一堆Rupees。
区域4：回到这里会来到那个巨大雕像上方的高台处，举起Medli让她带林克飞过去，先让Medli在光束下照射雕像的一只眼睛，直到它变成黄色，然后切换回林克站在另一光束下反射另一只眼睛。机关解除，蓝雾全部消散了，并且雕像下方出现了新的通道，由此来到B1F。
区域12：下了旋转通道后会看到吊桥，有一些比较烦人的飞行骷髅，他们一旦接触林克就会让他受诅咒，远远用弓箭干掉它们或者快速跑过去都可以。前面又出现音符石碑，需要林克和Medli合奏地圣者之曲才可解除。
区域13：先站在光束下把石块上的石像粉碎掉，然后进西边的门。
区域14：这里都是蓝雾和怪手，躲着点走，在尽头处取得一把钥匙 Small Key后返回。
区域13：进东侧门。
区域15：又是蓝雾和怪手，躲过去走到头，用骷髅锤砸机关，光束出现，然后把旁边那面镜子拉到光束下，光线就会照射到栅栏对面的区域，返回吧。
区域13：拿石块垫脚进入带锁门。
区域15：消灭掉那些幽灵怪，这里又需要Medli配合的双反射，把区域西部的石像粉碎掉，门出现。
区域16：好恐怖的一堆棺材呀~~有很多敌人，想打想跑都成。到尽头需要林克和Medli合奏地圣者之曲接触音符石碑机关。
区域17：一个圆形大厅，有螺旋通道。一眼就可以看到对面是BOSS房间的入口了，先别着急，还没钥匙呢。先把右首的传送坛上的石块炸掉，可以传送回迷宫入口附近。然后跟Medli一起顺着螺旋通道往下走。
区域18：如果掉到底部可以顺梯子爬上来。
区域19：好好复杂的机关室啊，听我慢慢道来。先让Medli飞上中央高台踩下机关，东南方会出现光束，林克把镜子推到光束下，然后反射中央高台下的石像，又出现一面镜子。把这个镜子拉到尽头，与Medli配合双反射粉碎东边区域的墙壁，把里面的镜子拉到尽头。OK，现在会有个特写画面，已经有4面镜子多重反射了。最后一束光会穿过中央平台，顺光束走到头，把那里的镜子推倒光束下，再利用新的光束反射中央平台的墙壁，又有一面镜子，拉到头，与Medli 配合双反射粉碎西北方的最后一面墙壁，把里面的镜子拉出来。终于机关全部解除了……不，是还有最后一道机关，看到北方墙壁上的双眼石像了吗?跟以前那个一样，Medli与林克一人反射一只眼睛，解除最后的机关，石像下方出现新的通道了。说的我一头汗，你也听晕了吧?其实并不难。另外这个区域里的坛子里有好多的Rupees哦。
这么复杂的机关要贴2张图留念一下下
区域21：腻味的战斗，一个盔甲男加上两只诅咒骷髅头，还是先消灭骷髅头吧，否则林克很容易无法攻击而被动挨打。将他们全部消灭后在里面的宝箱里得到巨型钥匙 Big Key，可以返回了。
区域18：林克顺墙上的藤条可以爬上去，Medli可以飞上去。
区域17：让Medli带着林克飞过悬崖到达迷宫BOSS的大门前吧。
☆Boss战：幽灵面具
必备装备：镜之盾，力量手镯
奖励物品：心之容器
神殿BOSS登场，横横因为本作的特点，所以所有的BOSS都是相当卡哇一的样子。一群小幽灵看到林克到来吓得四处奔逃，最后聚集在幽灵面具中变成一个手持油灯的大幽灵。它的攻击方式是用油灯抛出火焰燃烧林克，以及吸气和吐气，林克只要向相反方向跑就可以躲开，还有一种攻击方式就是蓝雾诅咒攻击，会使林克暂时无法使用武器，如果中招的话就先跟它周旋吧。
在战场周围全部都是尖刺，碰上了是要掉血地，还有4根尖刺柱子，可是对付BOSS的关键啊。首先，任何攻击对隐型BOSS都是无效的，所以不要锁定它。这个房间里有几道垂直光束你注意到了吧?先到光束下面，拿出盾来反射到BOSS身上一段时间，它就会一屁股坐在地上现出原形。这时立刻上前按A键举起 BOSS，对准墙边的尖刺柱子抛出去，BOSS就会散架，里面的小幽灵吓得满地乱跑，一个一个的用剑干掉吧。一段时间后剩余的小幽灵会重新回到幽灵面具中，并且光束的位置会随时变化和消失。这时再重复刚才的战术，直到把所有的小幽灵都消灭为止，幽灵面具也就在最后的阳光中粉身碎骨了。
胜利后得到一点新意都没有的奖品心之容器 Heart Container。
地之圣者终于苏醒，将圣者之剑的能力恢复了一半，剑鞘展开，但想恢复全部的能力，还需要搞定另一座神殿。Medli托付林克照顾鸟人王子后，就永远的守卫在这座神殿之中了。
☆风之圣者
冒险区域：Windfall Island -> Gale Isle -> Forest Heaven -> Gale Isle
下一步可以前往另一座神殿，中途经过商人岛的时候先歇个脚，等到黑夜，在药水店外面可以看到一个穿着褴褛的小姑娘，她就是曾经被关在恶魔要塞的受害者，当然破产的原因还是因为赎金都交给海盗了……走过去跟她搭讪会被恶狠狠的拒绝。离开她一些距离后，林克发现她开始鬼鬼祟祟的奔跑，一直在后面跟着她，注意保持距离，太近的话就需要重来了。最后她会跑到露天商店下的保险箱前撬东西，这时候赶快跑上去按A键捉住她。然后她会列举一大堆理由试图证明她是个好姑娘，不管那么多，只要所有的选项都选第1项就可以获得游戏中第4个瓶子 Empty Bottle。这时所有的瓶子都入手了，你的战斗会如虎添翼。
这最后一个瓶子的入手过程，实际上是个迷你游戏
接着可以向北航行到达巨石岛Gale Isle了。岛上刮着飓风，换上铁鞋即可慢慢移动到洞口，用骷髅锤砸碎吹风装置，这里的机关就解除了。
进到洞内，仍然看到一块音符石碑，上前照章吹奏，学会最后一首乐曲：风圣者之曲 Wind God's Aria。风之圣者的幽灵出现，同样，要想征服最后的神殿，就要找到世界上与风圣者拿着同一件乐器：小提琴的人。
入手乐曲风圣者之曲 Wind God's Aria
用途打开风之神殿之门，并开启神殿内部的部分机关
使用方法用风之杖演奏，先按住左摇杆右，再按C键上-》C键上-》C键下-》C键右-》C键左-》C键右，此曲乃攻略风之神殿必备之曲
持有小提琴这个家伙的印象应该比鸟人族那个还要深刻吧?因为林克曾经参加过一场森林音乐会呀。想起来没?就是在森之岛上林克拯救的被食人花吞掉的 Kokiri族：Makar。下一个目的地：森之岛Forest Heaven。找遍了也没找到Makar吗?呵呵，其实他就在刚上岛的瀑布后面，走到瀑布前可以听到提琴声，还有音符飘出来。拿出绳钩钩住枝杈即可荡入瀑布后，Makar就在那里。林克为他指挥风圣者之曲后，Makar成为苏醒后的风之圣者。
终于可以前往风之神殿了，龙舟会告诉林克操作Makar的方式和Medli基本相同，Makar也会卷起叶子来飞行。进入Gale Isle来到石碑前，合奏风圣者之曲，一同进入风之神殿。
☆迷宫：风之神殿
冒险区域：Wind Temple
迷宫地图
这个迷宫里Makar将成为林克的得力伙伴，一些重要机关都需要Makar来解除，他除了会飞以外，还可以在黄色的土壤上种树，长出来的树会解除一些机关，也可以作为林克的攀缘支柱。与上一个迷宫同样，林克每次进门时都要举着Makar通过，以防把他遗失。
区域1：前进前进前进进。
区域2：这里的土壤种出树来可以得到100Rupees。种树的方法是切换为Makar，然后走到黄色土壤上按A键。先让林克把周边的敌人清掉，前方通道的龙卷风会阻挡去路，让Makar飞过去到对面高台踩下开关，龙卷风就会消失。然后林克换上铁靴爬上那个弹射机关，再脱掉铁靴，林克就会被弹起来，弹到高空时赶快使用德古叶飞到对面平台去。
Makar种树以及林克在弹射台上穿上和脱掉铁靴弹射是本迷宫的基本解谜准则
区域3：用德古叶扇风车，通路打开，小心路上的移动机关。走到门前，让Makar种2棵树，前方的门打开。
区域4：切换为Makar，飞上3个平台，分别种3棵树，下方的门机关解除了，可是突然出现了怪手群，抓走了Makar。现在暂时无法到上面去救Makar，只有从右边的门通过。
区域6：这个广阔区域是连接3层迷宫的重要枢纽，中央是巨大的圆形铁平台。一进去就会听到Makar的召唤，他被关在这里北部的栅栏后，栅栏被一块巨大石像挡住，根据Makar的意见，想要移动石像，必须要有巨大的力气和德古树般的重量……不要着急，很快就会破解这个谜题。这里的敌人以前都见识过了，用炸弹消灭石像敌人可以得到不少宝贝，也可以躲着它们，先进入西侧门。
区域7：区域被阻隔，换上铁靴踩地上的破裂石块可以落到下层，小心怪手，用德古叶扇风车使平台落下，然后通过弹射开关穿脱铁靴弹回上层。这是最后一次提醒你使用弹射开关的方法喽。平台已放下可以前进了，尽头是音符石碑，现在没有Makar暂时无法解除，先进南侧的门。
区域8：这里是飞行区域，德古叶大显神威的地方。如果掉下去的话就需要顺藤条爬上来重新来过，注意魔力的损耗。先使用德古叶飞行乘龙卷风到达高处的平台，踩下开关，前方的栅栏会打开并形成通道。跳到栅栏通道上，借助下一个龙卷风飞行到靠南侧的区域，可以从宝箱中得到迷宫地图 Dungeon Map。回到上一个区域比较高的平台，借助龙卷风向西方飞，穿过栅栏后连续飞行，借助下一个龙卷风到达另一个栅栏平台上。前方会放火球的魔法师比较烦人，最好先用弓箭消灭它，然后借助最后一个龙卷风飞到尽头。
区域6：回到了区域6的南侧区域，打开旁边的传送坛。这里地上的铁机关要用铁靴踩到上面去解除。解除后，区域中央的圆形铁板打开了，可以直接跳到B1F去，好恐怖的一跳。
区域11：目前只有南侧门可以通行。
区域12：前方平台上都是尖刺，无法前进。换上铁靴踩地上的碎石，落到下层，消灭怪手。这里有一个可以推动的弹射台，抬头看前方的天花板可以看到一个缺口，把弹射台推到缺口下，再把另一个石头推到弹射台边上垫脚，从弹射台上弹到上方平台，从宝箱里得到钥匙 Small Key，返回吧。
区域11：进入带锁门。
区域10：小型BOSS战开始!敌方的主角是魔法师，会不断的召唤各种怪物前来参战，不想浪费时间的话就直接用弓箭干掉它吧。注意每次攻击命中后它都会隐形，在另一个地方出现，需要重新锁定它。胜利后宝箱出现，得到重要装备：链枪 Hookshot。OOT里的著名装备了。想离开这里，就需要使用链枪钩住平台上的靶形标志飞到上层，用骷髅锤砸下开关解除机关。
入手装备链枪 Hookshot
用途可以钩住靶形标志上行，可以把小型敌人从远处拉过来攻击
使用方法菜单中用XYZ键装备，按相应键瞄准，当目标变为星星状时放出即可钩住目标。