一切妥当后，御剑飞行到海底城。到达海底城一层，雪见吓唬龙葵，注意对话选项：
 
1、雪见跟你开玩笑呢。　　　　　　　　　　　雪见好感度+3 龙葵好感度+3
 
2、龙太子不是坏人，但是唐姐姐却是坏人。　　雪见好感度+0 龙葵好感度+5
 
3、是啊……他会吃掉你的！　　　　　　　　　雪见好感度+5 龙葵好感度+0
 
正式进入海底城。游戏第二十一个迷宫，注意拾取道具，存盘点存档。从海底城一层中央下去到达二层。
 
海底城第二层总图
 
 


 
海底城二层：迷宫很简单，主要就是按顺序踩中央、东南、西北三个飘板。 另外可以看到头顶两条飞龙索道，找入口上去走到尽头各有一大宝箱。注意拾取全部道具。可参照海底城第二层总图。
 
土属性宝箱：海底城二层的第一条龙。物品：蹙金云履，烟月神镜，烛龙内丹，紫石乳，神机四枢丸
 
风属性宝箱：海底城二层的第二条龙。物品：【琥珀】，天香续命露，无忧仙果，寒山枫，毒龙胆，千叶刃
 
【矿石提示】：琥珀——海底城二层风属性宝箱
 
【尸块】：混沌舍利*1   巨石人   炼狱火海（景天32级   获取概率30%    卖价3000）
 
合成：琥珀 + 混沌舍利 —— 长卿 —— 星辰剑  土  武+250 
 
提示：海底城迷宫中的许多怪物可以偷窃不错的道具。魔镜偷窃得到烟月神镜（前期烟月神镜准备不足的可以偷一些）；神将军偷窃得到偷搜宝鼠、莲花宝座偷窃得到神机四枢丸。
 
海底城三层：地图四个角落的房间中间各有一个踏板机关需要踩一下。四个机关都开启后，回到地图中央高台，踩踏板可以到达四层。注意拾取全部道具。
 
 


 
海底城四层：出口在正北，存盘点西边有个大宝箱。注意拾取全部道具。存盘点存档。
 
水属性宝箱：海底城四层的存盘点往西走。物品：【镇海青金石】，寿葫芦，紫菁玉蓉膏，玄天异果，天心海棠，神机四枢丸
 
【矿石提示】：镇海青金石——海底城四层水属性宝箱
 
 


 
海底城五层：要点是走新的浮台，不要走返回的浮台。只有一条路走到尽头。注意拾取道具。尽头有存盘点，务必注意存档。
 
 


 
海底城五层，存盘点存档后。触发剧情、发生战斗。
 
水碧：神/水/精10000/神400/武490/防100速/7/运15/水5/火0/雷0/风0/土0/经验12477/金钱4200
 
溪风：魔/风/精13000/神350/武583/防90/速12/运14/水0/火0/雷0/风5/土0/经验13400/金钱4200
 
巨灵神乙：神/土/精14000/神280/武750/防75/速2/运12/水0/火0/雷0/风0/土5/经验29040/金钱3800
 
帝江神兽：神/火/精16000/神400/武700/防80/速12/运14/水0/火5/雷0/风0/土0/经验29040/金钱3800
 
战斗为连续三场，中间全部是剧情，且每场不会自动恢复精、神。建议装备回精、回神（封神结）的装备饰物。第一场：水碧、溪风，第二场：两只巨灵神乙，第三场：帝江神兽。
 
三场战斗难度稍稍高，如果未曾练过级，身上也没有用尸块冶炼出来的顶级装备，建议补血为上，稳扎稳打。如若人物级别较高，一身冶炼终极装备，随意虐（笔者甚至不需要补血……）。注意己方施加有利状态、敌人施加不利状态。注意给BOSS投掷减速砂减速、软骨浆减武。（尤其是帝江神兽，速快、攻高）。我方则尽可能使用高价组合仙术攻击敌人。注意“五气连波”、“承天载物”等群体回血技能。注意魔剑技的使用，魔剑技“幻水惊雷”增益我方状态，可配合使用合击技；魔剑技“极咒返阴阳”恢复我方精、神，极为实用。坚持几个回合，战斗胜利。注意：帝江神兽最后一招需要使用“风雪冰天”，以求打出尸块。
 
【尸块】：神兽革*1   帝江神兽   风雪冰天（景天45级  获取概率20%  卖价4500；只有一次机会） 
 
合成：火烷 + 神兽革 —— 长卿 —— 天帝祭服  水  防+115  速-1  精恢复15％
 
BOSS尸块仅此一次机会，不过尸块掉落概率20%。若没打出来，读档重来吧。仙剑三游戏共有3个BOSS尸块掉落概率较低，需要运气与耐心，这是第2个。有收集控的玩家唯有存档——读档大法反复打取，一般重复5次左右会打出尸块，运气差点10次左右亦会打出来。当然，该尸块需要连续打三场BOSS战，合成装备亦不算极品，玩家可以根据自己喜好选择是否打取该尸块！
 
笔者推荐方法：对于一身冶炼极品装备，人物等级亦算不错的玩家。战斗前装备回精、回神装备。（尤其是回神装备，封神结必不可少）。景天使用“风雪冰天”、雪见使用“承天载物”、龙葵前两场使用“天雷破空”第三场防御或一直防御、紫萱使用“风雪冰天”。第一回合选择行动指令后，之后一直R键重复。战斗速度超快！甚至读档——存档一次不超过两分钟。纵然尸块神兽革掉落概率不高，很快便会打出来。
 
笔者运气不佳，第八次时方才打出该尸块。PS：打出该尸块唯一技巧便在于重复刷概率，只要保证阵中不站人，最后帝江神兽是被“风雪冰天”打死的即可。与敌我双方的运等其他因素无关。（已被证实）。
 
战胜溪风、水碧后，剧情获得：圣灵珠 （可战斗中作为暗器使用，召唤武神，类似风、雷、土、火灵珠，一共三次使用机会）。战胜巨灵神、帝江神兽后，获得第十颗（最后一颗）龙精石，从法阵回到安溪。
 
笔者推荐魔剑净化方案中，第十颗龙精石已经无用。喜好魔剑技：水+火+雷+风+土——天地元灵斩（敌方全体减少精900），可以进行第十次魔剑净化！
 
回到安溪，完成一个支线任务。即游戏最后一个支线任务。
 
【支线43】：安溪——花楹
 
从海底城返回之后，在安溪客栈听潮居客房甲中，与花楹和王彝对话。出来后，在客栈走廊中与王彝对话，根据花楹好感度不同，剧情会有所不同。之后，进入安溪最北部的民居，（位置可参照安溪总图），与王彝对话，若花楹好感不是最低，可使花楹好感+3。 
 
主线剧情：在安溪客栈右边，（位置可参照安溪总图），一民房后看到幽会的一对男女，得知剑冢的魔炉之火再度燃起。然后到安溪出口，遇到蜀山弟子，了解情况后，大家决定前往剑冢。